Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf6Q9D4J7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms