Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Efhd1Q9D4J1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Efhd1Q9D4J1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms