Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul2Q9D4H8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms