Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
4933402D24RikQ9D4D3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933402D24RikQ9D4D3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms