Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933428M09RikQ9D3X3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms