Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Fndc8Q9D2H8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Fndc8Q9D2H8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Fndc8Q9D2H8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Fndc8Q9D2H8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Fndc8Q9D2H8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Fndc8Q9D2H8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Fndc8Q9D2H8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Fndc8Q9D2H8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc8Q9D2H8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Fndc8Q9D2H8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Fndc8Q9D2H8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc8Q9D2H8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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