Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snapc3Q9D2C9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms