Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Creb3l4Q9D2A5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms