Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chordc1Q9D1P4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms