Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D1K7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D1K7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D1K7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms