Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbr1lQ9D1E5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1lQ9D1E5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms