Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms