Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snf8Q9CZ28 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms