Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prelid3bQ9CYY7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prelid3bQ9CYY7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms