Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx7Q9CY18 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms