Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RpainQ9CWY9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RpainQ9CWY9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms