Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prkrip1Q9CWV6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms