Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Khdc3Q9CWU5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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