Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CWU4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CWU4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CWU4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CWU4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CWU4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms