Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdca4Q9CWM2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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