Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sycp2Q9CUU3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sycp2Q9CUU3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms