Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms