Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prps2Q9CS42 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prps2Q9CS42 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prps2Q9CS42 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prps2Q9CS42 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms