Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd1Q9CRY7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gdpd1Q9CRY7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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