Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRW3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRW3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms