Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nkiras2Q9CR56 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms