Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PsenenQ9CQR7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms