Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms