Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DenrQ9CQJ6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DenrQ9CQJ6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms