Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snrpb2Q9CQI7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpb2Q9CQI7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms