Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb5Q9CQH3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms