Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms