Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms