Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms