Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp3Q9CQ10 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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