Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY3

Cdca5, Sororin, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca5Q9CPY3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdca5Q9CPY3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdca5Q9CPY3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms