Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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