Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms