Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms