Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms