Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms