Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pink1Q99MQ3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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