Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1b4Q99ME6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms