Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprtQ99M80 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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