Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms