Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RtcbQ99LF4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms