Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms