Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q99KU6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q99KU6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q99KU6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q99KU6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q99KU6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q99KU6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q99KU6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q99KU6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q99KU6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q99KU6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms