Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed9Q99KF1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms