Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlgn1Q99K10 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlgn1Q99K10 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlgn1Q99K10 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlgn1Q99K10 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms